Tavallisesti kutakin DNA -molekyylin sisällä soluja sisältää kaksi osaa liitetään yhteen vuorovaikutusta kutsutaan vetysidoksia . Olosuhteiden muutos voi kuitenkin ” Denaturointiin ” DNA ja aiheuttaa näitä säikeitä erottua. Lisäämällä vahvoja emäksiä , kuten NaOH: lla, lisää merkittävästipH: ssa, mikä vähentää vety- ioni- liuoksen pitoisuus ja denaturoiva kaksijuosteinen DNA . Effects of pH
hydroksidi- ioni -pitoisuus ja pH-arvo on suora korrelaatio , eli mitä korkeampi pH on, sitä suurempi on hydroksidi -pitoisuus . Samoin alempivetyionipitoisuus laskee . Korkeassa pH: ssa , sitten liuos on runsaasti hydroksidi-ioneja , ja nämä negatiivisesti varautuneita ioneja voi vetää vety- ioneja pois molekyyleihin kutenemäsparia DNA: ta. Tämä prosessi häiritseevetysidoksen , joka pitääkahden DNA langat yhteen , jolloin ne erottaa .
RNA vs. DNA
Toisin kuin RNA , DNA puuttuuhydroksyyliryhmä 2 asemaa kullekin sokerin ryhmässä . Tämä ero tekee DNA paljon vakaampi emäksisessä liuoksessa . RNA , hydroksyyliryhmä2 asento voi luopuavety- ionin liuokseen korkeassa pH: ssa , mikä luo hyvin reaktiivinen alkoksidi- ioni , joka hyökkää fosfaatti- ryhmä , jolla kaksi vierekkäistä nukleotidia yhteen . DNA ei kärsi tästä viasta ja siten nauttii merkittävää vakautta korkeassa pH: ssa .
Alkaline Lyysi
Molekyylibiologit käytetään usein emäksistä denaturaatiota eristää plasmidi DNA bakteereista . Plasmidit ovat vähän silmukoita DNA erilläänbakteerikromosomin . Vuonnaemäksinen lyysi miniprep , biologit lisää pesuainetta ja natriumhydroksidia bakteereille keskeytettiin liuoksessa . Pesuaine liukeneebakteerien solukalvon , kun taas natriumhydroksidia lisää pH: ta ja tekee ratkaisusta erittäin emäksinen . Kutenrikki -solut vapauttavat sisältönsä ,DNA: n sisällä erottuu sen komponentin säikeistä tai denaturoituu .
Uudelleenpariutumisen
Kunbiologi poimii DNA solusta , hän lisää toisen reagenssin palata ratkaisulisää neutraaliin pH-arvoon ja sakkapesuainetta . PH: n muutos mahdollistaa sen, että plasmidi- säikeiden reanneal ; vieviä kromosomi , mutta ei voi tehdäsamaa , jotenbiologi voi poistaa sitä yhdessäpesuaineen , denaturoitu proteiineja ja muita sekalaisia roskaa , jättäenplasmidi takana . Alkaline lysis ei täysin puhdistaa plasmidi-DNA ; Pikemminkin se toimii” nopea ja likainen ” tapa purkaa sitä solusta ja poista useimpia muita epäpuhtauksia .